Una de las formas para bloquear una IP desde la configuración de apache es por medio del archivo de configuración del VirtualHost
Apache 2.4
<Directory "/var/www/htdocs">
RewriteEngine On
Options FollowSymLinks
AllowOverride All
<RequireALL>
Require all granted
Require not ip xxx.xxx.xxx.xxx
</RequireALL>
</Directory>
